Analiza e parë e gjurmueshmërisë bazuar në gjenomin e plotë të Brucella abortus në Provincën Zhejiang - Ekipi i Bioinformatikës nga Macro & Micro-Test kontribuon në publikimin e përbashkët

—— Studim bashkëpunues nga Zhejiang CDC, Macro & Micro-Test, dhe China CDC Botuar në Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

Përmbledhje e Studimit

Në maj 2026, Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (JCR Q1, IF ≈ 4.6) publikoi një punim të udhëhequr nga Qendra Provinciale e Zhejiang për Kontrollin dhe Parandalimin e Sëmundjeve (Zhejiang CDC), me ekipin e bioinformatikës nga Beijing Macro & Micro-Test Bio-Tech Co., Ltd. dhe Institutin Kombëtar për Kontrollin dhe Parandalimin e Sëmundjeve të Ngjitshme (China CDC) si bashkautorë. Studimi titullohet:
"Identifikimi dhe analiza filogjenetike e shtatë llojeve të Brucella abortus në Zhejiang, Kinë."
Brucella abortus

Ky studim përfaqëson analizën e parë sistematike të gjurmueshmërisë filogjenetike të bazuar në të gjithë gjenomin e Brucella abortus (B. abortus) në Provincën Zhejiang, Kinë. Ekipi analizoi shtatë izolate të mbledhura nga viti 2015 deri në vitin 2025 (katër lloje me origjinë njerëzore dhe tre me origjinë gjedhi nga Jinhua, Quzhou dhe Ningbo). Gjetjet ofrojnë prova gjenomike për origjinën dhe rrugët e transmetimit të kësaj "specie dominuese veriore" në një rajon epidemik atipik jugor të Kinës lindore.

 

Sfondi dhe Rëndësia

 

Bruceloza është një sëmundje zoonotike e shkaktuar nga bakteret e gjinisë Brucella. Brucella abortus infekton kryesisht bagëtinë, por mund të shkaktojë sëmundje edhe tek njerëzit. Në Kinë, bruceloza tregon variacion të theksuar gjeografik: incidenca më e lartë ndodh në provincat veriore (p.sh., Mongolia e Brendshme, Shanxi, Heilongjiang). Në të kundërt, provincat jugore, përfshirë Zhejiang, historikisht janë dominuar nga Brucella melitensis, me shumë pak raste të raportuara të B. abortus. Kjo pabarazi rajonale e bën karakterizimin gjenetik dhe gjurmimin e burimit të B. abortus në Zhejiang një përparësi kyçe të shëndetit publik.

 

Metodat dhe Gjetjet Kryesore

Ekipi i kërkimit miratoi një strategji shumëplanëshe që kombinonte biologjinë molekulare dhe bioinformatikën:

1.Identifikimi i patogjenit dhe tipizimi bazë

PCR e gjenit BCSP-31 dhe AMOS-PCR konfirmuan që të shtatë izolatet ishin B. abortus.

Tipizimi i sekuencës multilokusale (MLST) bazuar në nëntë gjene "housekeeping" zbuloi se të gjitha izolatet i përkisnin tipit të sekuencës ST2, duke treguar homogjenitet të lartë gjenetik midis llojeve të B. abortus që qarkullojnë në Zhejiang.
Identifikimi i patogjenit dhe tipizimi bazë

2.Karakterizimi i të gjithë gjenomit

Sekuencimi i të gjithë gjenomit u krye në platformën Illumina NovaSeq. Analiza mesatare e identitetit të nukleotideve (ANI) tregoi se izolatet Zhejiang ndanin deri në 99.99% ngjashmëri me llojin referues B. abortus 544.

Analiza pan-gjenomike zbuloi një popullatë shumë të konservuar: u identifikuan 3,084 gjene thelbësore, së bashku me vetëm 10 gjene të guaskës, dhe nuk u zbuluan gjenet e bërthamës së butë ose të reve.

图片1

 

3.Profilet e gjeneve të virulencës dhe rezistencës ndaj antimikrobikëve

U parashikuan gjithsej 68 faktorë të lidhur me virulencën, duke mbuluar rrugë klasike si biosinteza e LPS, sistemi i sekretimit T4SS dhe sistemi rregullator dykomponentësh BvrR-BvrS. Veçanërisht, të gjitha izolatet nuk kishin gjenet e adezinave bmaA dhe btaF. Analiza e gjenit të rezistencës zbuloi vetëm gjenin mprF në bazën e të dhënave CARD, pa identifikuar përcaktues të tjerë të rezistencës.

Virulencë4. Rindërtimi filogjenetik dhe gjurmimi i transmetimit

Analiza e polimorfizmit me një nukleotid të vetëm të gjenomit bërthamë (cgSNP) i vendosi izolatet Zhejiang në një pozicion specifik në pemën filogjenetike globale. Rezultatet treguan se llojet e Zhejiang formojnë një grup monofiletik së bashku me llojet nga Rusia, Mongolia dhe disa provinca veriore kineze (Ningxia, Heilongjiang, Mongolia e Brendshme, Hebei, Gansu, Pekin). Ky grup ndahet më tej në tre nënklada të dallueshme (Klada 1-3), duke sugjeruar ngjarje të shumëfishta të pavarura të hyrjes.

Rindërtimi filogjenetik

Përfundime dhe Implikime

 

Ky studim ofron të dhënat e para gjenomike me saktësi të lartë të B. abortus në Provincën Zhejiang dhe jep disa përfundime kryesore:

 

  1. Clear sfond gjenetik– Llojet e B. abortus që qarkullojnë në Zhejiang i përkasin ST2, janë shumë të ruajtura gjenomikisht dhe përfaqësojnë një linjë tipike të brucelozës së gjedhit.

 

2. Evidendësia e transmetimit ndër-rajonal– Analiza filogjenetike nuk mbështet ekzistencën e një linje endemike të pavarur në Zhejiang. Në vend të kësaj, të dhënat sugjerojnë fuqimisht se këto lloje kanë origjinën nga Kina veriore dhe mund të ndajnë një sfond të përbashkët evolucionar me llojet nga Rusia dhe Mongolia. Prania e tre nënkladeve nënkupton ngjarje të shumëfishta të veçanta hyrëse.

 

3. Implikimet në shëndetin publik– Gjetjet nënvizojnë vlerën e mbikëqyrjes gjenomike për brucelozën edhe në rajone tradicionalisht jo endemike si Zhejiang. Edhe pse numri aktual i rasteve është i ulët, mjetet me rezolucion të lartë si cgSNP mund të gjurmojnë në mënyrë efektive burimin e shpërthimeve të importuara dhe të ofrojnë prova shkencore për të ndërprerë zinxhirët e transmetimit të lidhur me transportin ndërkrahinor të bagëtive.

 

Ky punim jo vetëm që mbush një boshllëk kërkimor në Provincën Zhejiang, por gjithashtu ofron të dhëna të reja bazë për mbikëqyrjen e patogjenëve dhe vlerësimin e rrezikut të brucelozës në rajonin e deltës së lumit Jance.

 

Informacion mbi dokumentin:
Yang, Y., Shi, X., Chen, J., Wang, L., Wu, Z., Yao, W., … & Wu, B. (2026). Identifikimi dhe analiza filogjenetike e shtatë llojeve të Brucella abortus në Zhejiang, Kinë. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 16, 1758965.

 

 


Koha e postimit: 10 qershor 2026