Një armë e re për diagnostikimin e tuberkulozit dhe zbulimin e rezistencës ndaj ilaçeve: Një sekuencim i synuar i gjeneratës së re (tNGS) i kombinuar me mësimin automatik për diagnostikimin e mbindjeshmërisë ndaj tuberkulozit
Raporti i literaturës: CCa: një model diagnostikues i bazuar në tNGS dhe të mësuarit automatik, i cili është i përshtatshëm për njerëzit me tuberkuloz dhe meningjit tuberkuloz më pak bakterial.
Titulli i tezës: Sekuencimi i gjeneratës së ardhshme i synuar për tuberkulozin dhe të mësuarit automatik: një strategji diagnostikuese ultra-sensitive për tubulat pulmonare paucifike dhe meningjitin tubular.
Periodikisht: 《Clinica Chimica Acta》
NËSE: 6.5
Data e publikimit: Janar 2024
Në bashkëpunim me Akademinë e Shkencave të Universitetit të Akademisë Kineze të Shkencave dhe Spitalin e Kraharorit të Pekinit të Universitetit Mjekësor të Kryeqytetit, Macro & Micro-Test krijoi një model diagnostikimi të tuberkulozit bazuar në gjeneratën e re të teknologjisë së sekuencimit të synuar (tNGS) dhe metodën e të mësuarit automatik, e cila siguroi ndjeshmëri ultra të lartë zbulimi për tuberkulozin me pak baktere dhe meningjit tuberkuloz, ofroi një metodë të re diagnostikimi të mbindjeshmërisë për diagnozën klinike të dy llojeve të tuberkulozit dhe ndihmoi në diagnozën e saktë, zbulimin e rezistencës ndaj ilaçeve dhe trajtimin e tuberkulozit. Në të njëjtën kohë, është zbuluar se ADN-ja cf e plazmës së pacientit mund të përdoret si një lloj mostre e përshtatshme për marrjen e mostrave klinike në diagnostikimin e TBM-së.
Në këtë studim, u përdorën 227 mostra plazme dhe mostra të lëngut cerebrospinal për të krijuar dy grupe klinike, në të cilat mostrat e grupit diagnostikues laboratorik u përdorën për të krijuar modelin e të mësuarit automatik të diagnozës së tuberkulozit, dhe mostrat e grupit diagnostikues klinik u përdorën për të verifikuar modelin diagnostikues të krijuar. Të gjitha mostrat u shënjestruan së pari nga një grup sondash kapëse të projektuara posaçërisht për Mycobacterium tuberculosis. Pastaj, bazuar në të dhënat e sekuencimit TB-tNGS, modeli i pemës së vendimeve përdoret për të kryer validim të kryqëzuar 5-fish në grupet e trajnimit dhe validimit të radhës diagnostikuese laboratorike, dhe merren pragjet diagnostikuese të mostrave të plazmës dhe mostrave të lëngut cerebrospinal. Pragu i marrë sillet në dy grupe testimi të radhës diagnostikuese klinike për zbulim, dhe performanca diagnostikuese e nxënësit vlerësohet nga kurba ROC. Së fundmi, u mor modeli i diagnozës së tuberkulozit.
Fig. 1 diagram skematik i dizajnit të hulumtimit
Rezultatet: Sipas pragjeve specifike të mostrës së ADN-së së Lëngut Cerebrospinal (AUC = 0.974) dhe mostrës së ADN-së cf të plazmës (AUC = 0.908) të përcaktuara në këtë studim, midis 227 mostrave, ndjeshmëria e mostrës së Lëngut Cerebrospinal ishte 97.01%, specifikiteti ishte 95.65%, dhe ndjeshmëria dhe specifikiteti i mostrës së plazmës ishin 82.61% dhe 86.36%. Në analizën e 44 mostrave të çiftëzuara të ADN-së cf të plazmës dhe ADN-së së lëngut cerebrospinal nga pacientët me TBM, strategjia diagnostikuese e këtij studimi ka një konsistencë të lartë prej 90.91% (40/44) në ADN-në cf të plazmës dhe ADN-në e lëngut cerebrospinal, dhe ndjeshmëria është 95.45% (42/44). Tek fëmijët me tuberkuloz pulmonar, strategjia diagnostikuese e këtij studimi është më e ndjeshme ndaj mostrave të plazmës sesa rezultatet e zbulimit Xpert të mostrave të lëngut gastrik nga të njëjtët pacientë (28.57% VS 15.38%).
Fig. 2 Performanca e analizës së modelit të diagnozës së tuberkulozit për mostrat e popullsisë
