Një armë e re për diagnostikimin e tuberkulozit dhe zbulimin e rezistencës ndaj drogës: Një sekuencë e synuar e gjeneratës së re (tNGS) e kombinuar me mësimin e makinerisë për diagnozën e mbindjeshmërisë së tuberkulozit
Raporti i literaturës: CCa: një model diagnostikues i bazuar në tNGS dhe mësimin e makinerive, i cili është i përshtatshëm për njerëzit me tuberkuloz më pak bakterial dhe meningjit tuberkuloz.
Titulli i tezës: Sekuenca e gjeneratës së ardhshme të synuar nga tuberkulozi dhe mësimi i makinerive: një strategji diagnostikuese ultra e ndjeshme për tubularët pulmonar paufik dhe meningjitin tubular.
Periodikisht: 《Clinica Chimica Acta》
IF: 6.5
Data e publikimit: Janar 2024
Kombinuar me Universitetin e Akademisë Kineze të Shkencave dhe Spitalin e gjoksit të Pekinit të Universitetit Mjekësor Capital, Macro & Micro-Test krijoi një model diagnostikimi të tuberkulozit bazuar në teknologjinë e gjeneratës së re të sekuencës së synuar (tNGS) dhe metodës së mësimit të makinerive, e cila siguroi shumë të lartë zbulimi i ndjeshmërisë për tuberkulozin me pak baktere dhe meningjitin tuberkuloz, siguroi një metodë të re të diagnostikimit të mbindjeshmërisë për diagnostikimin klinik të dy llojeve të tuberkulozit dhe ndihmoi në diagnostikimin e saktë, zbulimin e rezistencës ndaj ilaçeve dhe trajtimin e tuberkulozit.Në të njëjtën kohë, konstatohet se cfDNA e plazmës së pacientit mund të përdoret si një lloj kampioni i përshtatshëm për kampionimin klinik në diagnostikimin e TBM.
Në këtë studim, 227 mostra të plazmës dhe mostrave të lëngut cerebrospinal u përdorën për të krijuar dy grupe klinike, në të cilat mostrat e grupit diagnostikues laboratorik u përdorën për të vendosur modelin e mësimit makine të diagnozës së tuberkulozit dhe mostrat e grupit diagnostik klinik u përdorën për të verifikuar modeli diagnostik.Të gjitha mostrat u shënjestruan fillimisht nga një grup sondë kapjeje e projektuar posaçërisht për Mycobacterium tuberculosis.Më pas, bazuar në të dhënat e renditjes së TB-tNGS, modeli i pemës së vendimit përdoret për të kryer një verifikim të kryqëzuar 5-fish në grupet e trajnimit dhe vërtetimit të radhës diagnostikuese laboratorike dhe merren pragjet diagnostike të mostrave të plazmës dhe mostrave të lëngut cerebrospinal.Pragu i marrë sillet në dy grupe testesh të radhës së diagnozës klinike për zbulim dhe performanca diagnostike e nxënësit vlerësohet nga kurba ROC.Më në fund u mor modeli i diagnostikimit të tuberkulozit.
Fig. 1 diagrami skematik i projektimit të kërkimit
Rezultatet: Sipas pragjeve specifike të kampionit të ADN-së CSF (AUC = 0.974) dhe mostrës cfDNA të plazmës (AUC = 0.908) të përcaktuara në këtë studim, midis 227 mostrave, ndjeshmëria e kampionit CSF ishte 97.01%, specifika ishte 95.65% dhe ndjeshmëria dhe specifika e kampionit të plazmës ishin 82,61% dhe 86,36%.Në analizën e 44 mostrave të çiftuara të cfDNA-së së plazmës dhe ADN-së së lëngut cerebrospinal nga pacientët me TBM, strategjia diagnostike e këtij studimi ka një konsistencë të lartë prej 90.91% (40/44) në cfDNA të plazmës dhe ADN-në e lëngut cerebrospinal, dhe ndjeshmëria është 95.45%. (42/44).Tek fëmijët me tuberkuloz pulmonar, strategjia diagnostike e këtij studimi është më e ndjeshme ndaj mostrave të plazmës sesa rezultatet e zbulimit të Xpert të mostrave të lëngut gastrik nga të njëjtët pacientë (28,57% VS 15,38%).
Fig. 2 Performanca e analizës së modelit të diagnostikimit të tuberkulozit për mostrat e popullsisë
